《钢铁飞龙2》是一部26集的三维动画片。故事讲述了曾被奥特曼打败和驱逐出地球的外星人再度入侵，这个时候奥特曼却因为执行任务身处宇宙边缘，无法保护地球。这些外星人具有各种各样奇怪的能力，面对这样一股外来势力的威胁，地球世安局原有的防护力量也捉襟见肘。关键时候，钢铁飞龙小队再次挺身而出，与正在归来的奥特曼一起，为保护地球而战斗。